A magyar Országgyűlés 2015 decemberében visszaállította a valamennyi élelmiszerlánc-szereplőre korábban egységesen alkalmazott, egy ezrelékes élelmiszerlánc-felügyeleti díjfizetési kötelezettséget, így az Európai Bizottság élelmiszerlánc-felügyeleti díjjal kapcsolatos legutóbbi döntése nem igényel Magyarországon újabb változtatásokat.
A Földművelésügyi Minisztérium korábban azért kívánt áttérni a progresszív díjfizetési formára, mert az óriási forgalmat lebonyolító multinacionális nagyvállalatok élelmiszerbiztonsági szempontból nagyobb kockázatot jelentenek, mint a kevesebb árutételt értékesítő társaik. Hiszen egy esetlegesen hibás termék megjelenése - a gyors árumozgás, a nagyobb vásárlólétszám és az egyszerre nagyobb tömegű áru értékesítése miatt – nagyobb kockázatot jelent. A fentiek miatt e szektor felügyelete jelentősebb ellenőrzési kapacitásokat köt le.
Fontos hangsúlyozni, hogy az élelmiszerlánc-felügyeleti díjfizetési kötelezettség nem minősül adónak, az az európai élelmiszerjog alapján fizetendő szolgáltatási díj.